Como todos los juegos de Pokémon, hay algunos que sólo aparecen en una de las ediciones y deben ser intercambiados para completar la Pokédex. La siguiente lista contiene algunos Pokémon que reviven de fósiles, los cuales pueden ser recibidos en el juego contrario si se transfiere el objeto, por lo tanto no son 100% exclusivos de esa versión.

Núm.	Pokémon		Tipos	Habilidad	Estadísticas
					PS	Ata	Def	At.Esp	Def.Esp	Vel	Total
#140		Kabuto		Nado Rápido Armadura Batalla Armadura Frágil	30	80	90	55	45	55	355
#141		Kabutops		Nado Rápido Armadura Batalla Armadura Frágil	60	115	105	65	70	80	495
#250		Ho-oh		Presión Regeneración	106	130	90	110	154	90	680
#273		Seedot		Clorofila Madrugar Hurto	40	40	50	30	30	30	220
#274		Nuzleaf		Clorofila Madrugar Hurto	70	70	40	60	40	60	340
#275		Shiftry		Clorofila Madrugar Hurto	90	100	60	90	60	80	480
#303		Mawile		Corte Fuerte Intimidación Potencia Bruta	50	85	85	55	55	50	380
#335		Zangoose		Inmunidad Ímpetu Tóxico	73	115	60	60	60	90	458
#338		Solrock		Levitación	70	95	85	55	65	70	440
#383		Groudon		Sequía	100	150	140	100	90	90	670
#410		Shieldon		Robustez Insonorizar	30	42	118	42	88	30	350
#411		Bastiodon		Robustez Insonorizar	60	52	168	47	138	30	495
#422		Shellos		Viscosidad Colector Poder Arena	76	48	48	57	62	34	325
#423		Gastrodon		Viscosidad Colector Poder Arena	111	83	68	92	82	39	475
#484		Palkia		Presión Telepatía	90	120	100	150	120	100	680
#538		Throh		Agallas Foco Interno Rompemoldes	120	100	85	30	85	45	465
#566		Archen		Flaqueza	55	112	45	74	45	70	401
#567		Archeops		Flaqueza	75	140	65	112	65	110	567
#641		Tornadus		Bromista Competitivo	79	115	70	125	80	111	580
#643		Reshiram		Turbollama	100	120	100	150	120	90	680
#690		Skrelp		Polvo Escudo Ojo Compuesto	80	52	50	90	50	89	411
#691		Dragalge		Rivalidad Nerviosismo Autoestima	62	50	58	73	54	72	369

Núm.	Pokémon		Tipos	Habilidad	Estadísticas
					PS	Ata	Def	At.Esp	Def.Esp	Vel	Total
#138		Omanyte		Nado Rápido Caparazón Armadura Frágil	35	40	100	90	55	35	355
#139		Omastar		Nado Rápido Caparazón Armadura Frágil	70	60	125	115	70	55	495
#249		Lugia		Presión Compensación	106	90	130	90	154	110	680
#270		Lotad		Nado Rápido Cura Lluvia Ritmo Propio	40	30	30	40	50	30	220
#271		Lombre		Nado Rápido Cura Lluvia Ritmo Propio	60	50	50	60	70	50	340
#272		Ludicolo		Nado Rápido Cura Lluvia Ritmo Propio	80	70	70	90	100	70	480
#302		Sableye		Vista Lince Rezagado Bromista	50	75	75	65	65	50	380
#336		Seviper		Mudar Allanamiento	73	100	60	100	60	65	458
#337		Lunatone		Levitación	70	55	65	95	85	70	440
#382		Kyogre		Llovizna	100	100	90	150	140	90	670
#408		Cranidos		Rompemoldes Potencia Bruta	67	125	40	30	30	58	350
#409		Rampardos		Rompemoldes Potencia Bruta	97	165	60	65	50	58	495
#422		Shellos		Viscosidad Colector Poder Arena	76	48	48	57	62	34	325
#423		Gastrodon		Viscosidad Colector Poder Arena	111	83	68	92	82	39	475
#483		Dialga		Presión Telepatía	100	120	120	150	100	90	680
#539		Sawk		Robustez Foco Interno Rompemoldes	75	125	75	30	75	85	465
#564		Tirtouga		Roca Sólida Robustez Nado Rápido	54	78	103	53	45	22	355
#565		Carracosta		Roca Sólida Robustez Nado Rápido	74	108	133	83	65	32	495
#642		Thundurus		Bromista Competitivo	79	115	70	125	80	111	580
#644		Zekrom		Terravoltaje	100	150	120	120	100	90	680
#692		Clauncher		Rivalidad Nerviosismo	86	68	72	109	66	106	507
#693		Clawitzer		Velo Flor Simbiosis	44	38	39	61	79	42	303