Pokémon Ranger Batonnage es un manga que acompañó a la salida del juego Pokémon Ranger - Sombras de Almia para la consola Nintendo DS, y al igual que su versión predecesora, este manga fue hecho por los mismos encargados que hacen el manga de Pokémon Special; historia de Hidenori Kusaka e ilustraciones de Satoshi Yamamoto.
Fue publicado en la web de pokemon.jp y sólo es accesible a los miembros del Daisuki Club. Fue lanzado un capítulo cada mes hasta completar toda la historia. La aventura se centra en cómo el TOP Ranger principal Hajime intenta detener a la Organización Yami Yami, quienes quieren controlar a todos los Pokémon con ayuda de unos aparatos inventados por ellos, llegando a controlar al poderoso Darkrai, quien cae en las garras del enemigo.
Asi, Hajime junto a Hitomi deben detenerlos y rescatar a Darkrai. Este manga está inspirado en la misión especial WiFi donde debemos rescatar al oscuro Pokémon.