Pokémon Shuffle ha recibido una gran cantidad de novedades en el último paquete de datos que podemos obtener usando el Registro. En primer lugar, si hemos acabado dentro de los 20.000 primeros puestos en el ranking del torneo de Mega-Lucario, obtendremos una Lucarita como recompensa.

Otra novedad es la adición de 15 nuevos niveles del modo normal, así como el nuevo evento Superreto para atrapar a Keldeo que durará hasta el 6 de Abril.

También se ha añadido un nuevo set de Pokémon del día, con Pachirisu, Sigilyph, Tropius, Farfetch'd y Druddigon.