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En Pokémon Mundo Misterioso: Portales al Infinito, puedes jugar como uno de estos cinco Pokémon: Pikachu, Snivy, Tepig, Oshawott o Axew. Entre este grupo de Pokémon, también podrás elegir a un compañero que permanecerá a tu lado a lo largo de toda la aventura. Cada Pokémon tiene sus puntos fuertes y talentos propios, así que elige con total libertad la combinación de Pokémon que más te guste.
| Pikachu |
 El Pokémon de tipo Eléctrico Pikachu puede aprender poderosos movimientos de tipo Eléctrico durante la aventura. |
| Oshawott |
 Si quieres jugar con un Pokémon de tipo Agua, elige a Oshawott como protagonista. |
| Snivy |
 Tal vez lo que estás buscando para el combate sean los movimientos de tipo Planta que Snivy puede aprender. |
| Tepig |
 El Pokémon de tipo Fuego Tepig puede ser la elección que mantenga el fuego durante tu aventura. |
| Axew |
 También puedes elegir al Pokémon de tipo Dragón Axew al principio de tu aventura. |